MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 14943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013941	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013941	GCT	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013941	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013941	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013941	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013941	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013941	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013941	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013941	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013941	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013941	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013941	GA	3	6	5090	5095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013941	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013941	CGC	2	6	5168	5173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013941	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013941	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013941	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013941	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013941	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013941	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013941	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013941	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013941	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013941	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013941	C	6	6	9899	9904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_013941	G	6	6	9909	9914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013941	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013941	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013941	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013941	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013941	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013941	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013941	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_013941	TGC	2	6	10810	10815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013941	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013941	T	6	6	11355	11360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013941	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013941	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013941	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013941	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013941	T	6	6	11886	11891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013941	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013941	A	6	6	11991	11996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013941	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013941	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013941	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013941	A	7	7	12068	12074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013941	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013941	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013941	A	6	6	14160	14165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013941	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013941	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013941	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013941	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013941	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013941	T	6	6	15785	15790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013941	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013941	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013941	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013941	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013941	AACA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013941	ACA	2	6	15891	15896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013941	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013941	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013941	TTC	2	6	16024	16029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013941	A	6	6	16040	16045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013941	ATT	2	6	16049	16054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013941	GAT	2	6	16079	16084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013941	GA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013941	ATA	2	6	22442	22447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013941	A	6	6	22468	22473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013941	ATC	2	6	23012	23017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013941	TTAA	2	8	23019	23026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013941	GTT	2	6	23072	23077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013941	ATT	2	6	23078	23083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013941	T	6	6	23100	23105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013941	TGA	2	6	23124	23129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013941	ATT	2	6	23154	23159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013941	CTT	2	6	23162	23167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013941	AAG	2	6	23171	23176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013941	CAT	2	6	23187	23192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013941	ATT	2	6	23231	23236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013941	T	6	6	23235	23240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013941	TTAA	2	8	23253	23260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013941	CTT	2	6	23293	23298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013941	T	6	6	23297	23302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013941	TGA	2	6	24749	24754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013941	TTAAT	2	10	24762	24771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013941	ACT	2	6	24787	24792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013941	AAG	2	6	24816	24821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013941	TAA	2	6	24861	24866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013941	GAG	2	6	24882	24887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013941	TA	3	6	24908	24913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013941	GT	3	6	25115	25120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013941	TC	3	6	25121	25126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013941	AGC	2	6	25139	25144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013941	A	7	7	25151	25157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013941	CTT	2	6	25529	25534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013941	TGC	2	6	30123	30128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013941	AGC	2	6	31590	31595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013941	T	6	6	31632	31637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013941	TCAT	2	8	32589	32596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013941	TCCC	2	8	32619	32626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_013941	TGGC	2	8	32660	32667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013941	ATG	3	9	33565	33573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013941	ATTTA	2	10	33586	33595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013941	TCT	2	6	33685	33690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013941	TGT	2	6	33696	33701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013941	TCT	2	6	33761	33766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013941	TGC	2	6	33767	33772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013941	GAT	2	6	33797	33802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013941	CATG	2	8	33829	33836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013941	ATA	2	6	33846	33851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013941	A	6	6	33853	33858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013941	GCC	2	6	33901	33906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013941	TCG	2	6	33920	33925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013941	TCA	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013941	AGTG	2	8	33979	33986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013941	GAT	2	6	39060	39065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013941	GATGC	2	10	39086	39095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013941	CAG	2	6	39128	39133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013941	CGC	2	6	39152	39157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013941	GGGC	2	8	42246	42253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013941	GCG	2	6	43546	43551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013941	ATTT	2	8	46346	46353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013941	GTTT	2	8	46363	46370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013941	ATT	3	9	46394	46402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013941	ATT	2	6	46519	46524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013941	TGTTA	2	10	46533	46542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013941	A	7	7	46553	46559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013941	CGC	2	6	50159	50164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013941	A	6	6	50180	50185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013941	ATT	2	6	51562	51567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013941	AT	3	6	51585	51590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013941	TGTT	2	8	54057	54064	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013941	GCG	2	6	54081	54086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013941	GA	3	6	54095	54100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013941	CAA	2	6	59700	59705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013941	CAT	2	6	62074	62079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013941	GTG	2	6	62164	62169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013941	GT	3	6	62289	62294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013941	ATG	2	6	63134	63139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013941	GCC	2	6	63167	63172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_013941	CTT	2	6	63183	63188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013941	TGG	2	6	63212	63217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013941	TAAAAA	2	12	63323	63334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013941	TATT	2	8	63367	63374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_013941	TCT	2	6	139918	139923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_013941	CCT	2	6	140802	140807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_013941	A	7	7	140822	140828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013941	ATA	2	6	140838	140843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_013941	TC	3	6	142990	142995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
295	NC_013941	TGA	2	6	143008	143013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_013941	AAC	2	6	143128	143133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_013941	TAG	2	6	145585	145590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_013941	TG	3	6	145613	145618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
301	NC_013941	TCA	2	6	145623	145628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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322	NC_013941	GA	3	6	152368	152373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_013941	AT	3	6	219314	219319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_013941	T	6	6	219342	219347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_013941	C	6	6	219433	219438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
419	NC_013941	A	6	6	220313	220318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_013941	A	7	7	222120	222126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_013941	CTT	2	6	224229	224234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_013941	ATT	2	6	224237	224242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_013941	TGT	2	6	224245	224250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_013941	ATT	2	6	225939	225944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_013941	TAT	2	6	225945	225950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_013941	TTA	2	6	226104	226109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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